如何查阅文献

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更新配音幻灯视频:

  • 面向对象: 不满足于查百度的人. 医疗药品/ 器械相关企业从业者.

  • 学习目的: 对一个自己不熟悉的领域, (此处为医学), 快速查阅文献, 了解基础知识.

  • 要求:

    • 基础的英语水平: 现在青少年的初中二年级水平. 如果是成年人, 考虑到成人的能力通常会迅速下降, 大概大学4级水平吧.
    • 会使用Chrome浏览器或Firefox浏览器.
    • 会安装Chrome插件或Firefox插件.
    • 可能需要具备“正常访问国际互联网”的能力.

本教程以眼科“OK镜”为例. 场景是这样的, 你带着自己(或好友)的娃去看了看眼睛, 发现近视了. 医生推荐了OK镜, 但这东西好贵啊, 你想自己也多了解一些. 公司可能最近也有往这方面代理产品/研发产品的意图. 所以, 你打算自己再查查资料.

图文教程, 图片比较多. (如果看不到图片, 可能是因为广告过滤器阻止了sm.ms的图床调用, 需要将i.loli.net许可)

软件的准备

  • Chrome浏览器: 本教程按照Chrome浏览器来讲解. 下载Chrome离线版的方法不在此赘述, 可以参考知乎上的教程

  • ScholarScope插件: 用来显示文献的影响因子, 可以视为一个文献质量的评分吧. ScholarScope插件的下载和使用在其官方网站上有详细的解说

  • 彩云小译网页翻译插件: 非必须, 但我真的喜欢看中英文对照的翻译, 所以用上这个插件, 类似网页翻译工具应该还有很多. 国内大概有道, 腾讯, 搜狗之类的都多多少少有类似的东西.

合适的关键词

听到的只有“OK镜”这个词. 似乎是个缩略语, 那么应当选择什么关键词去寻找呢?

专业词汇的中英文互相翻译, 从CNKI的翻译助手开始, 网址是http://dict.cnki.net/

打开CNKI翻译助手, 输入“OK镜” 屏幕快照 2019-01-28 14.05.47

有两个候选词汇“OK lens”和“orthokeratology lenses”, 前者似乎是后者的缩写, 本着选择题选答案最长的原则, 我们将使用“orthokeratology lenses”

在Pubmed上查文献

PubMed, 是美国国家医学图书馆提供的一个医学搜索引擎. 某种程度上, 你就当这是医学文献唯一的搜索引擎好了. 除非是为了某些“医学考古”的研究目的, 否则PubMed上搜不到就意味着不重要或者不存在.

PubMed的网址很长, 是啰哩啰嗦的https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ 但通常使用pubmed.gov或者pubmed.org甚至pubmed.com都可以访问到.

在搜索框里填入orthokeratology lenses, 然后按Search, 出现如下结果: 屏幕快照 2019-01-28 14.13.59

从哪里开始看?

文献的重要性

搜索orthokeratology lenses有450篇文献, 如果不是这个专业的人, 没必要也没时间都看过一遍. 而且要看, 也要有个先后顺序. 我们刚才装好的ScholarScope插件, 就是为了如此.

如果之前装好了ScholarScope插件, 那么会在每篇文献的下面有一个数字和一个Q数字, 例如这篇文献的2.12和Q2, 前面的数字越大越重要, 后面的Qx, 数字越小越重要.

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文献的类型

在左上角, 还有一组限制条件 屏幕快照 2019-01-28 14.21.21

如果只是想快速了解一个领域, 当然应该先看看别人写好的综述, 也就是Review. 如果想知道疗效如何, 则可能应该要再看看临床实验Clinical Trials.

对于某些历史悠久的领域, 还可以限定只看5年以内的文献, 在Publication dates里选上5years.

对于OK镜, 还算是一个相对较新的领域, 从右边文献与年份的关系可以看出大约是在2000年以后热起来的. 屏幕快照 2019-01-28 14.24.12

我们先暂时不限定文献的类型, 而是快速浏览一下文献的题目和评分, 看看有没有感兴趣的.

快速浏览

说实话, 我只想读一篇, 满篇英文也挺烦的. 翻译一下吧:

点一下彩云小译的插件, 可以快速翻译页面中的文字, 如果觉得语句不太通顺, 影响理解, 就再看看英文原文是怎么写的. 屏幕快照 2019-01-28 14.36.13

大致看一下评分, 说实话分数都不高啊, 多数是在1-2分左右, 不过下面有一篇7分多的文章, 显得鹤立鸡群. 还是美国眼科学会报告. 看题目也是大而全, 貌似是不错的入门文章, 就从这里开始好了. 屏幕快照 2019-01-28 14.38.31

阅读摘要

点开这篇“Use of Orthokeratology for the Prevention of Myopic Progression in Children: A Report by the American Academy of Ophthalmology.” ,

你会看到一段摘要Abstract, 讲述了该文献的大致内容, 如果是临床试验研究, 往往读一下摘要就可以知道其研究结果, 如果嫌弃读英文烦, 也可以用上彩云小译的插件, 此处不再赘述.

但对于大而全的综述, 最好深入到原文中去读读详细. 屏幕快照 2019-01-28 14.42.50

找到全文

理论上, 文章的全文链接出现在右侧的“Full text links”, 但实际上往往点进去是要求付费的. 这是科学界自己也非常不爽的事情, 明明是拿着纳税人的钱做出的研究成果, 却无法分享给全社会, 而被科学杂志收取了费用, 甚至科学家自己不但没有稿费还经常要掏版面费.

于是此处应有侠盗出场, Scihub_raven

Sci-Hub, 由哈萨克斯坦软件开发暨神经技术研究生亚历珊卓·艾尔巴金（Alexandra Elbakyan）建立, 一个非常非常强大的全文数据库.

如果已经安装了ScholarScope插件, 去点击doi后面那一串数字, 就可以自动跳转到sci-hub的链接上. 屏幕快照 2019-01-28 14.55.41

或者,

这篇文献的网址是: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30476518

那么把 sci-hub.tw/ 加在文献网址的前面, 变成sci-hub.tw/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30476518 就可以找到全文了.

点击save, 就可以下载保存PDF全文了.屏幕快照 2019-01-28 15.00.27

阅读全文

显然还是阅读中文的速度快, 尤其是你可能对这个领域并不熟悉. 对于医学文献, 此处使用TransGod的PDF翻译.

打开https://fanyi.transgod.cn/ 勾选上“上传完成后自动翻译”再点击“上传文件”

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把刚才下载的PDF全文上传上去, 1分钟左右就能够翻译完成, 然后下载译文即可

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得到一篇Word文档. 我对他们能够把PDF这种丧心病狂的格式处理得如此服帖非常佩服. (为什么说PDF是丧心病狂的格式, 请参考理解数字世界中的纸张：PDF | 科普) 屏幕快照 2019-01-28 15.11.44

这篇文章居然是篇Meta分析, 简单的说就是汇总以前做过的正规临床实验的结果, 按照证据的强度汇总出来的一份报告.

个人建议用wiki或者其他的笔记软件, 记录一下文献阅读中获得的新识和心得.

注意, 虽然现在机器学习机器翻译的进步飞快, 但仍然不能代替阅读原文, 机器翻译的译文只是作为辅助, 用来快速浏览, 在涉及到细节的地方, 还是要仔细阅读原文的.

作业

你在微信里被问到这篇文章《帕金森终于有了特效药！》 中提到“CBD（大麻二酚）对于改善帕金森病患者病情效果非常显著。”. 本能的, 你觉得这很不靠谱, 请找出你的证据.